MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-11

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015903	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015903	AGG	2	6	3359	3364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015903	AGG	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015903	ACAAGC	2	12	4965	4976	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015903	GAA	3	9	4984	4992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015903	AAGC	2	8	5055	5062	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015903	TACT	2	8	5153	5160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015903	T	6	6	15484	15489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015903	TA	3	6	15510	15515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015903	TAAAAA	2	12	15525	15536	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015903	CAAT	2	8	16843	16850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015903	ATA	2	6	16863	16868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015903	CTA	2	6	17477	17482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015903	ATA	2	6	17508	17513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015903	TAA	2	6	17537	17542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015903	TTA	2	6	17548	17553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015903	ATT	2	6	17557	17562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015903	A	7	7	17566	17572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015903	CTT	2	6	18397	18402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015903	TAA	3	9	18414	18422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015903	T	8	8	18431	18438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015903	CTA	2	6	18889	18894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015903	TTGTTT	2	12	19022	19033	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015903	AT	3	6	19078	19083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015903	CTT	2	6	19105	19110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015903	A	7	7	19126	19132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015903	TAT	2	6	19180	19185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015903	T	6	6	19185	19190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015903	TGTAG	2	10	19246	19255	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015903	TAAAAT	2	12	19263	19274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015903	TAA	2	6	19324	19329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015903	T	7	7	19343	19349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015903	CAT	2	6	19382	19387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015903	ATT	2	6	19398	19403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015903	TTA	2	6	21873	21878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015903	TAT	2	6	22852	22857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015903	TGA	2	6	22863	22868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015903	T	6	6	22927	22932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015903	TTTTA	2	10	22956	22965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015903	ACAAAT	2	12	22966	22977	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015903	TTG	2	6	23009	23014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015903	AAT	2	6	23028	23033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015903	TAA	2	6	23037	23042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015903	TTA	2	6	23066	23071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015903	TAA	2	6	23092	23097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015903	TAT	2	6	23109	23114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015903	AGG	2	6	23118	23123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015903	TTA	2	6	23142	23147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015903	CAAA	2	8	23182	23189	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015903	T	7	7	23218	23224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015903	TA	5	10	23254	23263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015903	A	6	6	23275	23280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015903	A	6	6	23294	23299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015903	T	7	7	23359	23365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015903	AAG	2	6	23381	23386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015903	TA	3	6	23407	23412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015903	A	6	6	24778	24783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015903	AAT	2	6	24791	24796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015903	A	6	6	26083	26088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015903	TGCA	2	8	26146	26153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015903	TAA	2	6	26177	26182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015903	G	6	6	26201	26206	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015903	AAGA	2	8	26214	26221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015903	AT	3	6	26238	26243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015903	TGTGT	2	10	26271	26280	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015903	TAGG	2	8	26293	26300	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015903	GA	3	6	26313	26318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015903	A	6	6	26402	26407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015903	ATT	2	6	26413	26418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015903	A	7	7	26637	26643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015903	AAG	3	9	26648	26656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015903	A	7	7	26930	26936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015903	AGAAAA	2	12	26960	26971	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015903	AAGAGA	2	12	26972	26983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015903	AAC	2	6	26992	26997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015903	AAG	2	6	27007	27012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015903	GAA	2	6	27015	27020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015903	A	6	6	27019	27024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015903	ATA	2	6	27088	27093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015903	TTTA	2	8	27643	27650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015903	TA	3	6	27649	27654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015903	CT	3	6	27655	27660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015903	ATT	2	6	28106	28111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015903	ACT	2	6	28123	28128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015903	TAA	2	6	28215	28220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015903	ATTA	2	8	28221	28228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015903	AATA	2	8	28256	28263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015903	CAA	2	6	28286	28291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.